xubuntuを14.10にアップグレード。
一通り終了してリブートしてみるとマウスカーソル(マウスポインタ)が見えない。右クリックするとメニューが出てくるのでマウスが動作していないのではなく、カーソルが見えないだけと思われる。あとxmodmapによるキー入れ替えも効いていない。
いろいろ検索してみたが、英語で検索して同様の事例発見。xubutu14.10特有の問題のよう。解決策は gnome-settings-daemonのアンインストール。
無事解決した。キー入れ替えも動作している。firefoxでカーソル位置によってメニューバーへのショートカットキーが使えない現象も解消された。